蛋白質化学工学研究室(2017年度まで)の修了生・卒業生・在籍者

博士 学位論文

  • 白石 都(2017)
    Studies on a Novel DNA Repair Enzyme, Endonuclease Q from Archaea and Bacteria
  • 尾木野 弘実 (2015)
    Studies on the activation of the replicative helicase from the thermophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum(好熱性アーキアThermoplasma acidophilumにおけるDNA複製ヘリカーゼ活性化機構に関する研究)
  • Yang Yantao(2012)
    Studies on RAD2/XPG family endonucleases, OsGEN-L and OsSEND-1, and on the clamp molecule, OsPCNA, from Oryza sativa (イネ(Oryza sativa)由来RAD2/XPGファミリーエンドヌクレアーゼOsGEN-LとOsSEND-1、及びクランプ分子OsPCNAに関する研究)
  • 河村 啓 (2012)
    遺伝子工学酵素ビジネスの分析と新技術開発を目指したDNA複製因子の研究
  • 福永 健三(2011)
    Study on the activation mechanism of ATM-related protein kinase Tel1 as a DNA damage checkpoint response (DNA損傷チェックポイント応答におけるATM関連タンパク質キナーゼTel1活性化機構の研究)
  • 秋田 眞季 (2009、大阪大学生命機能研究科)
    Studies on the proteins involved in the initiation process of archaeal DNA replication (アーキアの DNA 複製開始に関与するタンパク質因子の研究)
  • 吉用 武弘 (2008)
    超好熱性アーキア Pyrococcus furiosus の DNA 複製開始・伸長過程に関わるタンパク質因子の生化学的研究
  • 松川 博昭 (2008)
    多様な遺伝子情報の取得とキメラ酵素作製を基盤としたファミリーB型 DNAポリメラーゼの構造と機能に関する研究
  • 中西 豪(2007)
    Development of On-Membrane Profiling Method for Phosphoproteins
  • 清成 信一 (2007)
    Studies on the molecular mechanism of DNA ligation
     〜 structure and functions of the ATP-dependent DNA ligase 〜
  • 當利 和夫 (2007)
    アーキアのゲノム複製と安定性維持機構に関わる基礎分子生物学的研究
  • 今村 馨 (2006)
    超好熱性アーキア Aeropyrum pernix のDNA複製フォーク進行機構に関する研究
  • 宮田 知子(2005)
    DNA相同組換えと複製に関わる超分子複合体の構造と機能に関する研究
  • 藤兼 亮輔(2005, 大阪大学理学研究科)
    Studies on Hjm helicase from the hyperthermophilic archaeon, Pyrococcus furiosus
  • 入江 寿朗 2004年度 博士後期課程修了
  • 喜多 正人 2004年度 博士後期課程修了
  • 服部 辰彦 2003年度 博士後期課程修了

修士 学位論文

2017年度

  • 佐々木 琢也
    超好熱性アーキアにおける新規ミスマッチ修復機構の解明
  • 新川 千鶴
    Sulfolobus tokodaii 7 株由来タンパク質の機能解析
  • 唐 雅璐 (Yalu Tang)
    Detection of the interaction between GINS, Family D DNA polymerase and Primase in Thermococcus kodakarensis
  • 水垂 裕一
    バクテリアMycobacterium aromaticivorans におけるDNA ミスマッチ修復系の機能についての研究
  • 吉田 光太郎
    損傷塩基修復に関わる酵素Endonuclease Qの作用機構の解明に向けて
  • 綿谷 江梨
    超好熱性アーキアThermococcalesのDNA複製ヘリカーゼ複合体関連因子の機能解析

2016年度

  • 小林 康平
    超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisの複製ヘリカーゼ複合体に関する研究 ~ GINS-GANの相互作用解析 ~

2015年度

  • 織田 宗一郎
    超好熱性アーキア由来ミスマッチDNA特異的エンドヌクレアーゼの構造と機能に関する研究
  • 梶谷 泰之
    鎖置換活性を有するTaq DNAポリメラーゼの創製とその応用に関する研究
  • 永田 麻梨子
    Studies on two RecJ-like nucleases from the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis
  • 渡辺 夏美
    Clamp-assisted PCRを目指したTaq DNA polymeraseの改変とその応用に関する研究

2014年度

  • 濱砂 孝文
    好熱性アーキアのThermococcalesに特有のエキソヌクレアーゼ(Exonuclease I)の生化学的解析と相互作用因子の探索
  • 牧田 成人
    DNA損傷修復に関わる新規酵素 Endonuclease Q の性質解析

2013年度

  • 白石 都
    Identification and characterization of a novel repair endonuclease from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus furiosus
  • 恒川 冴恵
    蛋白質工学による優れたPCR酵素の創製に向けた研究
  • 西 祐紀
    超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来NucSのミスマッチ切断活性に関する研究

2012年度

  • 輿 貴文
    メタゲノム解析より組立てたCaldiarchaeum subterraneumに見出されたFamily Y DNA polymeraseの機能解析
  • 能塚 悠輔
    Thermococcus kodakarensis由来Hjmヘリカーゼに関する研究
  • 山中 啓吾
    ヒトFANCMの天然変性領域との相互作用タンパク質の網羅的探索から見いだした修復関連タンパク質の生化学的解析
  • Jacqueline Büttiker (2012, Master of Sciences in Life Sciences FHNW)
    Purification and characterization of a B-family polymerase and PCNA from the archaeon Candidatus Caldiarchaeum subterraneum.

2011年度

  • 井田 梨沙
    超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis 由来Primaseの機能解析
  • 尾木野 弘実
    Studies on DNA replication factors from the archaeon, Thermoplasma acidophilum
  • 亀丸 美里
    超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisのDNAポリメラーゼDに含まれる天然変性領域に注目した構造と機能に関する研究
  • 北村 真
    超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来のDNA修復因子Hefの天然変性領域に関する研究
  • 藤野 誠司
    超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisのDNA複製機構解明に向けた GINS, MCM の機能と相互作用に関する研究

2010年度

  • 江頭 由里子
    超好熱性アーキアPyrococcus furiosus のエンドヌクレアーゼVによるヒポキサンチン塩基除去修復機構に関する研究
    金尾 弥生
    タンパク質工学による新規有用DNAポリメラーゼの創製研究
  • 久場 由真仁
    超好熱性アーキアThermococcus kodakaraensisが有する二種類のPCNAの機能解析および相互作用因子の探索に関する研究
  • 平田 励
    アーキアにおけるDNA修復タンパク質Hefの生化学的機能に関する研究

2009年度

  • 田島 優美
    超好熱性アーキアPyrococcus furiosus複製フォーク形成複合体における因子間相互作用
  • 瀧石 祐太
    超好熱性アーキアThermococcus kodakaraensis由来 Family D DNAポリメラーゼに関する生化学的機能解析
  • 向井 彩子
    耐熱性ATP再生系の構築とDNA組換え反応への応用
  • 高尾 宏一
    超好熱性アーキアThermococcus kodakaraensis由来Minichromosome Maintenance (MCM) タンパク質の生化学的機能解析
  • 原野 満平
    Pyrococcus furiosusプライマーゼとの相互作用因子の探索
  • 田畑 健一郎
    Studies on DNA repair mechanisms focused on XPB homologs from the hyperthermophilic archaeon, Pyrococcus furiosus

2008年度

  • 足立 彰紀
    超好熱性アーキアPyrococcus furiosusを用いた複製前複合体形成機構に関する研究
  • 跡部 朋美
    DNA複製と協調した修復系に関わるHef蛋白質に関する研究
  • 桑野 兼一
    超好熱メタン菌Methanopyrus kandleri由来DNAポリメラーゼに関する研究
  • 興梠 聖哉
    Pyrococcus furiosusのDNAポリメラーゼDに関する研究
  • 竹村 貴恵
    超好熱性アーキアのパイロコッカスにおけるDNA複製起点開裂機構
  • 田原 沙樹
    アーキアにおけるDNA上の損傷修復に関わる酵素学的研究
  • 奈須 えりこ
    超好熱性アーキアAeropyrum pernixのDNA複製因子の相互作用に関する研究

2007年度

  • 内村 真伊子
    超好熱性アーキアPyrococcus furiosus由来ウラシルDNAグリコシラーゼの作用機構に関する研究
  • 上河内 徹
    超好熱性アーキアAeropyrum pernix由来Hjmヘリカーゼの機能特性に関する研究
  • 鍋 健吾
    沖縄近海海底土壌メタゲノムを利用した新規有用DNAポリメラーゼの創製

2006年度

  • 手柴  智史
    カイコ(家蚕)スモール熱ショックタンパク質sHSP20.8およびsHSP19.9に関する研究
  • 門岡  裕介
    超好熱性アーキアAeropyrum pernix由来Hjmの機能解析
  • 川嶋 美穂
    超好熱アーキアPyrococcus furiosusにおけるDNA複製開始タンパク質間相互作用解析
  • 河野  倫
    超好熱性アーキアPyrococcus furiosus由来MutS2の生化学的解析

2005年度

  • 鬼塚 尚子
    沖縄近海海底土壌メタゲノムの多様性-DNAポリメラーゼ遺伝子の検索
  • 木水 めぐみ
    超好熱性アーキアPyrococcus furiosus由来DNAポリメラーゼに関する研究
  • 重岡 佑一
    好熱菌リポ酸アセチルトランスフェラーゼの解離・凝集
  • 中村 聖子
    NK細胞抑制型レセプターKLRG1(Killer cell Lectin-like Receptor G1)によるEカドヘリン認識の構造基盤
  • 福永 健三
    Aeropyrum pernixの損傷乗り越え修復機構解析
  • 宮地 希代子
    超好熱性アーキアにおけるDNA複製開始機構の解析:Cdc6/Orc1のヌクレオチド依存的形態変化および配列特異的DNA結合活性
  • 吉用 武弘
    超好熱性アーキアPyrococcus furisus 由来DNAトポイソメラーゼIIIの機能解析

2004年度

  • 吉永 亜耶
    超好熱性アーキアPyrococcus furiosus Hjmヘリカーゼの機能・構造解析
  • 長浜 祥之
    ジヒドロリポアミド脱水素酵素の熱失活機構に関する研究
  • 目野 高嗣
    Pyrococcus furiosus のDNA複製開始タンパク質Cdc6/Orc1の生化学的解析
  • 古川 信広
    PCNAとの相互作用によるHefエンドヌクレアーゼの基質特異性変換
  • 福島 由恵
    Pyrococcus furiosus の修復関連タンパク質の機能解析

2003年度

  • 今村 馨
    Aeropyrum pernix に存在する3種類のPCNAの機能に関する研究
  • 岩下 節
    新規プロプロテインコンベルターゼの構造と機能に関する研究
  • 岡 勇人
    Pyrococcus furiosus の新規DNAヘリカーゼに関する研究
  • 高山 耕平
    Pyrococcus furiosus DNAリガーゼに関する研究
  • 當利 和夫
    Pyrococcus furiosus のDNAポリメラーゼII(PolD)の構造と機能に関する研究
  • 森 繁美
    ヒトHEL308タンパク質の機能に関する研究

2002年度

  • 川波 美幸
    超好熱古細菌 Pyrococcus furiosus 由来 Mcmヘリカーゼの生化学的解析
  • 福田 登記
    好熱菌リポ酸アセチルトランスフェラーゼの熱失活機構に関する研究

学士 卒業論文

2017年度

  • 讃井 武蔵
    アーキアの複製ヘリカーゼとDNAポリメラーゼ間における相互作用解析
  • 瀬戸口 勇登
    超好熱性アーキアSulfolobus solfataricusにおけるDNA複製複合体構成タンパク質Gins51 と関わる新規DNA複製因子の探索
  • 峯 渉
    アーキアにおける機能的なMutS/MutLホモログの探索

2016年度

  • 沖 啓輔
    超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisのDNA複製複合体に関する研究
  • 川野 元一
    超好熱性アーキア由来ミスマッチ特異的エンドヌクレアーゼEndoMSの作用機構に関する研究
  • 工藤 華枝
    アーキアおよび真正細菌におけるミスマッチ修復系の分布と多様性についての研究

2015年度

  • 佐々木 琢也
    超好熱性アーキア由来ミスマッチ特異的エンドヌクレアーゼNucSの相互作用因子の探索
  • 唐 雅璐
    Detection of the interaction between GINS and Family D DNA polymerase in Thermococcus kodakarensis.
  • 原 智彦
    超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来ファミリーD DNAポリメラーゼの機能領域解析およびGINSとの相互作用解析
  • 吉田 光太郎
    損傷塩基修復に関わる酵素Endonuclease QとPCNAとの相互作用解析
  • 綿谷 江梨
    超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisのDNA複製ヘリカーゼ複合体に関わるタンパク質の相互作用および機能解析

2014年度

  • 小林 康平
    超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisの複製ヘリカーゼ複合体に関する研究 ~ GINS-GANの相互作用解析 ~

2013年度

  • 織田 宗一郎
    超好熱性アーキアのミスマッチ切断酵素NucSの構造と機能に関する研究
  • 佐藤 祐輔
    超好熱性アーキアPyrococcus furiosus由来DNAポリメラーゼ及びPCNAを用いたPCR酵素の改良
  • 永田 麻梨子
    Thermococcus kodakarensisの有する2つのRecJ様タンパク質の機能解析

2012年度

  • 濱砂 孝文
    超好熱性アーキアPyrococcus furiosus 由来新規3'-5'エキソヌクレアーゼPfuExo Iの構造と機能に関する研究
  • 牧田 成人
    アーキアのDNA損傷修復における新規ヌクレアーゼEndo Qの生化学的性質解析

2011年度

  • 白石 都
    アーキアの損傷塩基除去修復に関する研究〜ヒポキサンチン除去修復に関わる新規ヌクレアーゼの同定〜
  • 恒川 冴恵
    ファミリーA DNAポリメラーゼの配列比較に基づいて創製されたTaq DNAポリメラーゼ変異体の調製と性質解析
  • 牛草 健
    メタン生成アーキアMethanosarcina acetivorans C2A由来DNAリガーゼ-PCNA間の機能的相互作用に関する研究

2010年度

  • 山中 啓吾
    ヒト FANCM 天然変性領域の相互作用因子探索

2009年度

  • 井田 梨沙
    Thermococcus kodakaraensis 由来 GINS サブユニットの機能解析
  • 尾木野 弘実
    Thermoplasma acidophilum由来のGINSの構造と機能に関する研究
  • 藤野 誠司
    Thermococcus kodakaraensis 由来 GINS 複合体の機能・構造解析

2007年度

  • 田畑 健一郎
    Archaeal XPBヘリカーゼの生化学的機能解析

2006年度

  • 跡部 朋美
    超好気性好熱性古細菌Aeropyrum pernix k1 由来Helicase associated endonuclease for fork-structured DNA の生化学的性質解析
  • 田原 沙樹
    超好熱性アーキアPyrococcus furiosus 由来新規ヌクレアーゼPfuDNase Iの機能解析

2005年度

  • 上河内 徹
    超好熱古細菌 Aeropyrum pernix K1由来DNAリガーゼ –PCNA 間の相互作用およびコファクター要求生に関する研究

在籍者

  • 高島 夏希
  • 大門 克哉
  • 三城 美和 事務職員 (2013 – 2015年度)
  • 高藤 三加 テクニカルスタッフ (2014 – 2015年度)
  • 南雲 吉代 テクニカルスタッフ (2011-2013年度)
  • 清成(山川) 康子 事務職員 (2002 – 2013年度)
  • 藤兼(吉永) 亜耶 テクニカルスタッフ (2005年度、2010年度)
  • 清成 信一 学術研究員 (2007 – 2009年度)
  • 松川 博昭 学術研究員 (2009年度)
  • 今村 馨 学術研究員 (2007 – 2008年度)
  • 松永 藤彦 学術研究員 (2004 – 2007年度)
  • 麻生 陽一 准教授 (–– 2006年度)
  • 仲矢 丈夫 学術研究員 (2006年度)
  • 藤兼 亮輔 学術研究員 (2005 – 2006年度)
  • 國廣 華奈 テクニカルスタッフ (2003年度)

生物化学研究室(2017年度まで)

蛋白質化学工学研究室(2017年度まで)

  • 農学研究院 生命機能科学部門 生物機能分子化学講座 生物化学分野
  • 生物資源環境科学府 生命機能科学専攻 生物機能分子化学コース 生物化学分野
  • 農学部 応用生物科学コース 応用生命化学分野 生物化学研究室
  • Biological Chemistry, Department of Bioscience and Biotechnology, Graduate School of Bioresource and Bioenvironmental Sciences
  • システム生命科学府 生命工学講座 極限環境生物工学研究室
  • Biotechnology of Extremophiles, Division of Life Engineering, Graduate School of Systems Life Sciences
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