蛋白質化学工学研究室(2017年度まで)の修了生・卒業生・在籍者
博士 学位論文
白石 都(2017)
Studies on a Novel DNA Repair Enzyme, Endonuclease Q from Archaea and Bacteria
尾木野 弘実 (2015)
Studies on the activation of the replicative helicase from the thermophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum (好熱性アーキアThermoplasma acidophilum におけるDNA複製ヘリカーゼ活性化機構に関する研究)
Yang Yantao(2012) Studies on RAD2/XPG family endonucleases, OsGEN-L and OsSEND-1, and on the clamp molecule, OsPCNA, from Oryza sativa (イネ(Oryza sativa )由来RAD2/XPGファミリーエンドヌクレアーゼOsGEN-LとOsSEND-1、及びクランプ分子OsPCNAに関する研究)
河村 啓 (2012) 遺伝子工学酵素ビジネスの分析と新技術開発を目指したDNA複製因子の研究
福永 健三(2011) Study on the activation mechanism of ATM-related protein kinase Tel1 as a DNA damage checkpoint response (DNA損傷チェックポイント応答におけるATM関連タンパク質キナーゼTel1活性化機構の研究)
秋田 眞季 (2009、大阪大学生命機能研究科) Studies on the proteins involved in the initiation process of archaeal DNA replication (アーキアの DNA 複製開始に関与するタンパク質因子の研究)
吉用 武弘 (2008) 超好熱性アーキア Pyrococcus furiosus の DNA 複製開始・伸長過程に関わるタンパク質因子の生化学的研究
松川 博昭 (2008) 多様な遺伝子情報の取得とキメラ酵素作製を基盤としたファミリーB型 DNAポリメラーゼの構造と機能に関する研究
中西 豪(2007) Development of On-Membrane Profiling Method for Phosphoproteins
清成 信一 (2007) Studies on the molecular mechanism of DNA ligation 〜 structure and functions of the ATP-dependent DNA ligase 〜
當利 和夫 (2007) アーキアのゲノム複製と安定性維持機構に関わる基礎分子生物学的研究
今村 馨 (2006) 超好熱性アーキア Aeropyrum pernix のDNA複製フォーク進行機構に関する研究
宮田 知子(2005) DNA相同組換えと複製に関わる超分子複合体の構造と機能に関する研究
藤兼 亮輔(2005, 大阪大学理学研究科) Studies on Hjm helicase from the hyperthermophilic archaeon, Pyrococcus furiosus
入江 寿朗 2004年度 博士後期課程修了
喜多 正人 2004年度 博士後期課程修了
服部 辰彦 2003年度 博士後期課程修了
修士 学位論文
2017年度
佐々木 琢也
超好熱性アーキアにおける新規ミスマッチ修復機構の解明
新川 千鶴
Sulfolobus tokodaii 7 株由来タンパク質の機能解析
唐 雅璐 (Yalu Tang)
Detection of the interaction between GINS, Family D DNA polymerase and Primase in Thermococcus kodakarensis
水垂 裕一
バクテリアMycobacterium aromaticivorans におけるDNA ミスマッチ修復系の機能についての研究
吉田 光太郎
損傷塩基修復に関わる酵素Endonuclease Qの作用機構の解明に向けて
綿谷 江梨
超好熱性アーキアThermococcales のDNA複製ヘリカーゼ複合体関連因子の機能解析
2016年度
小林 康平
超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis の複製ヘリカーゼ複合体に関する研究 ~ GINS-GANの相互作用解析 ~
2015年度
織田 宗一郎
超好熱性アーキア由来ミスマッチDNA特異的エンドヌクレアーゼの構造と機能に関する研究
梶谷 泰之
鎖置換活性を有するTaq DNAポリメラーゼの創製とその応用に関する研究
永田 麻梨子
Studies on two RecJ-like nucleases from the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis
渡辺 夏美
Clamp-assisted PCRを目指したTaq DNA polymeraseの改変とその応用に関する研究
2014年度
濱砂 孝文
好熱性アーキアのThermococcalesに特有のエキソヌクレアーゼ(Exonuclease I)の生化学的解析と相互作用因子の探索
牧田 成人
DNA損傷修復に関わる新規酵素 Endonuclease Q の性質解析
2013年度
白石 都 Identification and characterization of a novel repair endonuclease from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus furiosus
恒川 冴恵 蛋白質工学による優れたPCR酵素の創製に向けた研究
西 祐紀 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis 由来NucSのミスマッチ切断活性に関する研究
2012年度
輿 貴文 メタゲノム解析より組立てたCaldiarchaeum subterraneum に見出されたFamily Y DNA polymeraseの機能解析
能塚 悠輔 Thermococcus kodakarensis 由来Hjmヘリカーゼに関する研究
山中 啓吾 ヒトFANCMの天然変性領域との相互作用タンパク質の網羅的探索から見いだした修復関連タンパク質の生化学的解析
Jacqueline Büttiker (2012, Master of Sciences in Life Sciences FHNW) Purification and characterization of a B-family polymerase and PCNA from the archaeon Candidatus Caldiarchaeum subterraneum .
2011年度
井田 梨沙 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis 由来Primaseの機能解析
尾木野 弘実 Studies on DNA replication factors from the archaeon, Thermoplasma acidophilum
亀丸 美里 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis のDNAポリメラーゼDに含まれる天然変性領域に注目した構造と機能に関する研究
北村 真 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis 由来のDNA修復因子Hefの天然変性領域に関する研究
藤野 誠司 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis のDNA複製機構解明に向けた GINS, MCM の機能と相互作用に関する研究
2010年度
江頭 由里子 超好熱性アーキアPyrococcus furiosus のエンドヌクレアーゼVによるヒポキサンチン塩基除去修復機構に関する研究 金尾 弥生 タンパク質工学による新規有用DNAポリメラーゼの創製研究
久場 由真仁 超好熱性アーキアThermococcus kodakaraensis が有する二種類のPCNAの機能解析および相互作用因子の探索に関する研究
平田 励 アーキアにおけるDNA修復タンパク質Hefの生化学的機能に関する研究
2009年度
田島 優美 超好熱性アーキアPyrococcus furiosus 複製フォーク形成複合体における因子間相互作用
瀧石 祐太 超好熱性アーキアThermococcus kodakaraensis 由来 Family D DNAポリメラーゼに関する生化学的機能解析
向井 彩子 耐熱性ATP再生系の構築とDNA組換え反応への応用
高尾 宏一 超好熱性アーキアThermococcus kodakaraensis 由来Minichromosome Maintenance (MCM) タンパク質の生化学的機能解析
原野 満平 Pyrococcus furiosus プライマーゼとの相互作用因子の探索
田畑 健一郎 Studies on DNA repair mechanisms focused on XPB homologs from the hyperthermophilic archaeon, Pyrococcus furiosus
2008年度
足立 彰紀 超好熱性アーキアPyrococcus furiosus を用いた複製前複合体形成機構に関する研究
跡部 朋美 DNA複製と協調した修復系に関わるHef蛋白質に関する研究
桑野 兼一 超好熱メタン菌Methanopyrus kandleri 由来DNAポリメラーゼに関する研究
興梠 聖哉 Pyrococcus furiosus のDNAポリメラーゼDに関する研究
竹村 貴恵 超好熱性アーキアのパイロコッカスにおけるDNA複製起点開裂機構
田原 沙樹 アーキアにおけるDNA上の損傷修復に関わる酵素学的研究
奈須 えりこ 超好熱性アーキアAeropyrum pernix のDNA複製因子の相互作用に関する研究
2007年度
内村 真伊子 超好熱性アーキアPyrococcus furiosus 由来ウラシルDNAグリコシラーゼの作用機構に関する研究
上河内 徹 超好熱性アーキアAeropyrum pernix 由来Hjmヘリカーゼの機能特性に関する研究
鍋 健吾 沖縄近海海底土壌メタゲノムを利用した新規有用DNAポリメラーゼの創製
2006年度
手柴 智史 カイコ(家蚕)スモール熱ショックタンパク質sHSP20.8およびsHSP19.9に関する研究
門岡 裕介 超好熱性アーキアAeropyrum pernix 由来Hjmの機能解析
川嶋 美穂 超好熱アーキアPyrococcus furiosus におけるDNA複製開始タンパク質間相互作用解析
河野 倫 超好熱性アーキアPyrococcus furiosus 由来MutS2の生化学的解析
2005年度
鬼塚 尚子 沖縄近海海底土壌メタゲノムの多様性-DNAポリメラーゼ遺伝子の検索
木水 めぐみ 超好熱性アーキアPyrococcus furiosus 由来DNAポリメラーゼに関する研究
重岡 佑一 好熱菌リポ酸アセチルトランスフェラーゼの解離・凝集
中村 聖子 NK細胞抑制型レセプターKLRG1(Killer cell Lectin-like Receptor G1)によるEカドヘリン認識の構造基盤
福永 健三 Aeropyrum pernix の損傷乗り越え修復機構解析
宮地 希代子 超好熱性アーキアにおけるDNA複製開始機構の解析:Cdc6/Orc1のヌクレオチド依存的形態変化および配列特異的DNA結合活性
吉用 武弘 超好熱性アーキアPyrococcus furisus 由来DNAトポイソメラーゼIIIの機能解析
2004年度
吉永 亜耶 超好熱性アーキアPyrococcus furiosus Hjmヘリカーゼの機能・構造解析
長浜 祥之 ジヒドロリポアミド脱水素酵素の熱失活機構に関する研究
目野 高嗣 Pyrococcus furiosus のDNA複製開始タンパク質Cdc6/Orc1の生化学的解析
古川 信広 PCNAとの相互作用によるHefエンドヌクレアーゼの基質特異性変換
福島 由恵 Pyrococcus furiosus の修復関連タンパク質の機能解析
2003年度
今村 馨 Aeropyrum pernix に存在する3種類のPCNAの機能に関する研究
岩下 節 新規プロプロテインコンベルターゼの構造と機能に関する研究
岡 勇人 Pyrococcus furiosus の新規DNAヘリカーゼに関する研究
高山 耕平 Pyrococcus furiosus DNAリガーゼに関する研究
當利 和夫 Pyrococcus furiosus のDNAポリメラーゼII(PolD)の構造と機能に関する研究
森 繁美 ヒトHEL308タンパク質の機能に関する研究
2002年度
川波 美幸 超好熱古細菌 Pyrococcus furiosus 由来 Mcmヘリカーゼの生化学的解析
福田 登記 好熱菌リポ酸アセチルトランスフェラーゼの熱失活機構に関する研究
学士 卒業論文
2017年度
讃井 武蔵
アーキアの複製ヘリカーゼとDNAポリメラーゼ間における相互作用解析
瀬戸口 勇登
超好熱性アーキアSulfolobus solfataricus におけるDNA複製複合体構成タンパク質Gins51 と関わる新規DNA複製因子の探索
峯 渉
アーキアにおける機能的なMutS/MutLホモログの探索
2016年度
沖 啓輔
超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis のDNA複製複合体に関する研究
川野 元一
超好熱性アーキア由来ミスマッチ特異的エンドヌクレアーゼEndoMSの作用機構に関する研究
工藤 華枝
アーキアおよび真正細菌におけるミスマッチ修復系の分布と多様性についての研究
2015年度
佐々木 琢也
超好熱性アーキア由来ミスマッチ特異的エンドヌクレアーゼNucSの相互作用因子の探索
唐 雅璐
Detection of the interaction between GINS and Family D DNA polymerase in Thermococcus kodakarensis.
原 智彦
超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis 由来ファミリーD DNAポリメラーゼの機能領域解析およびGINSとの相互作用解析
吉田 光太郎
損傷塩基修復に関わる酵素Endonuclease QとPCNAとの相互作用解析
綿谷 江梨
超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis のDNA複製ヘリカーゼ複合体に関わるタンパク質の相互作用および機能解析
2014年度
小林 康平
超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis の複製ヘリカーゼ複合体に関する研究 ~ GINS-GANの相互作用解析 ~
2013年度
織田 宗一郎 超好熱性アーキアのミスマッチ切断酵素NucSの構造と機能に関する研究
佐藤 祐輔 超好熱性アーキアPyrococcus furiosus 由来DNAポリメラーゼ及びPCNAを用いたPCR酵素の改良
永田 麻梨子Thermococcus kodakarensis の有する2つのRecJ様タンパク質の機能解析
2012年度
濱砂 孝文 超好熱性アーキアPyrococcus furiosus 由来新規3'-5'エキソヌクレアーゼPfuExo Iの構造と機能に関する研究
牧田 成人 アーキアのDNA損傷修復における新規ヌクレアーゼEndo Qの生化学的性質解析
2011年度
白石 都 アーキアの損傷塩基除去修復に関する研究〜ヒポキサンチン除去修復に関わる新規ヌクレアーゼの同定〜
恒川 冴恵 ファミリーA DNAポリメラーゼの配列比較に基づいて創製されたTaq DNAポリメラーゼ変異体の調製と性質解析
牛草 健 メタン生成アーキアMethanosarcina acetivorans C2A由来DNAリガーゼ-PCNA間の機能的相互作用に関する研究
2010年度
山中 啓吾 ヒト FANCM 天然変性領域の相互作用因子探索
2009年度
井田 梨沙 Thermococcus kodakaraensis 由来 GINS サブユニットの機能解析
尾木野 弘実 Thermoplasma acidophilum 由来のGINSの構造と機能に関する研究
藤野 誠司 Thermococcus kodakaraensis 由来 GINS 複合体の機能・構造解析
2007年度
田畑 健一郎 Archaeal XPBヘリカーゼの生化学的機能解析
2006年度
跡部 朋美 超好気性好熱性古細菌Aeropyrum pernix k1 由来Helicase associated endonuclease for fork-structured DNA の生化学的性質解析
田原 沙樹 超好熱性アーキアPyrococcus furiosus 由来新規ヌクレアーゼPfuDNase Iの機能解析
2005年度
上河内 徹 超好熱古細菌 Aeropyrum pernix K1由来DNAリガーゼ –PCNA 間の相互作用およびコファクター要求生に関する研究
在籍者
高島 夏希
大門 克哉
三城 美和 事務職員 (2013 – 2015年度)
高藤 三加 テクニカルスタッフ (2014 – 2015年度)
南雲 吉代 テクニカルスタッフ (2011-2013年度)
清成(山川) 康子 事務職員 (2002 – 2013年度)
藤兼(吉永) 亜耶 テクニカルスタッフ (2005年度、2010年度)
清成 信一 学術研究員 (2007 – 2009年度)
松川 博昭 学術研究員 (2009年度)
今村 馨 学術研究員 (2007 – 2008年度)
松永 藤彦 学術研究員 (2004 – 2007年度)
麻生 陽一 准教授 (–– 2006年度)
仲矢 丈夫 学術研究員 (2006年度)
藤兼 亮輔 学術研究員 (2005 – 2006年度)
國廣 華奈 テクニカルスタッフ (2003年度)
農学研究院 生命機能科学部門 生物機能分子化学講座 生物化学分野
生物資源環境科学府 生命機能科学専攻 生物機能分子化学コース 生物化学分野
農学部 応用生物科学コース 応用生命化学分野 生物化学研究室
Biological Chemistry, Department of Bioscience and Biotechnology, Graduate School of Bioresource and Bioenvironmental Sciences
システム生命科学府 生命工学講座 構造分子生物学研究室
Structural and Molecular Biology, Division of Life Engineering, Graduate School of Systems Life Sciences
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