九州大学大学院生物資源環境科学府　微生物遺伝子工学研究室

研究成果

原著論文

2015年

  1. K. Sakihara, J. Maeda, K. Tashiro, Y. Fujino, S. Kuhara, T. Ohshima, S. Ogata and K. Doi (2015) Draft genome sequence of thiostreptone producing Streptomyces azureus ATCC 1492, Genome A., 3, e 01183-15
  2. Wada, J. Kobayashi, M. Furukawa, K. Doi, T. Ohshiro, H. Suzuki (2015) A thiostrepton resistance gene and its mutants serve as selectable markers in Geobacillus kaustophilus HTA426, Biosci. Biotechnol. Biochem., in press
  3. H. Suzuki, J. Kobayashi, K. Wada, M. Furukawa, K. Doi (2015) Thermoadaptation-directed enzyme evolution in an error-prone thermophile derived from Geobacillus kaustophilus HTA426, Appl. Environ. Microbiol., 81, 149-158.
  4. J. Kobayashi, J. Yukimoto, Y. Shimizu, T. Ohmori, H. Suzuki, K. Doi, T. Ohshima （2015）Characterization of Lactobacillus salivarius alanine racemase: short-chain carboxylate-activation and the role of A131, SpringerPlus, in press

2014年

  1. H. Akita, H. Suzuki, K. Doi and T. Ohshima (2014) Efficient synthesis of D-branched-chain amino acids and their labeled compounds with stable isotopes using D-amino acid dehydrogenase. Appl. Microbiol. Biotechnol., 98: 1135-1143.
  2. T. H. Bang, H. Suhara, K. Doi, H. Ishikawa, K. Fukami, G. P. Parajuli, Y. Katakura, S. Yamashita, K. Watanabe, M. K. Adhikari, H. K. Manandhar, R. Kondo and K. Shimizu (2014) Wild mushroom in Nepal: Some potential candidates as antioxidant and ACE inhibition sources, Evid. Based Complement. Alternat. Med., 2014, Article ID 195305
  3. H. Akita, Y. Imaizumi, H. Suzuki, K. Doi and T. Ohshima (2014) Spectrophotometric assay of D-isoleucine using an artificially created D-amino acid dehydrogenase, Biotechnol. Lett., 36, 2245-2248.
  4. R. Ogura, T. Wakamatsu, Y. Mutaguchi, K. Doi and T. Ohshima (2014) Biochemical characterization of an L-tryptophan dehydrogenase from the photoautotrophic cyanobacterium Nostoc punctiforme, Enzyme Microb. Tech., 60, 40-46.

2013年

  1. H. Suzuki, K. Wada, M. Furukawa, K. Doi and T. Ohshima (2013) A ternary conjugation system to construct DNA libraries in Geobacillus kaustophilus HTA426, Biosci. Biotechnol. Biochem., 77, 2316-2318.
  2. K. Doi, K. Mori, H. Martono, Y. Nagayoshi, Y. Fujino, K. Tashiro, S. Kuhara and T. Ohshima (2013) Draft Genome Sequence of Geobacillus kaustophilus GBlys, a lysogenic strain with bacteriophage φOH2. Genome A., 1, e00634-13.
  3. T. Wakamatsu, C. Higashi, T. Ohmori, K. Doi and T. Ohshima (2013) Biochemical characterization of two glutamate dehydrogenases with different cofactor specificities from a hyperthermophilic archaeon Pyrobaculum calidifontis. Extremophiles, 17: 379-389.
  4. Y. Mutaguchi, T. Ohmori, H. Akano, K. Doi and T. Ohshima (2013) Distribution of D-amino acids in vinegars and involvement of lactic acid bacteria in the production of D-amino acids, SpringerPlus, 2, 691
  5. Y. Mutaguchi, T. Ohmori, T. Wakamatsu, K. Doi, and T. Ohshima (2013) Novel amino acid racemase, isoleucine 2-epimerase, from Lactobacillus species: Identification, purification and characterization, J. Bacteriol., 195, 5207-5215.
  6. K. Doi, Y. Nishizaki, H. Kimura, M. Kitahara, Y. Fujino, S. Ohmomo, T. Ohshima and S. Ogata (2013) Identification of thermo tolerant lactic acid bacteria isolated from silage prepared in the hot and humid climate of Southwestern Japan, SpringerPlus, 2, 485.
  7. K. Doi, K. Mori, Y. Mutaguchi, K. Tashiro, Y. Fujino, T. Ohmori, S. Kuhara and T. Ohshima (2013) Draft Genome Sequence of D-branched-chain amino acids producing Lactobacillus otakiensis JCM 15040T isolated from a traditional Japanese pickle, Genome A., 1, e00546-13
  8. K. Doi, O. T. A. Phuong, F. Kawatou, Y. Nagayoshi, Y. Fujino and T. Ohshima (2013) Identification and characterization of lactic acid bacteria isolated from fermented rice bran product, Adv. Microbiol., 3, 265-272.
  9. J. Kobayashi, Y.Shimizu, Y. Mutaguchi, K. Doi and T. Ohshima (2013) Characterization of D-amino acid aminotransferase from Lactobacillus salivarius, J. Mol. Catal. B: Enzym., 94, 15–22.
  10. K. Doi, K. Mori, K. Tashiro, Y. Fujino, Y. Nagayoshi, Y. Hayashi, S. Kuhara and T. Ohshima (2013) Draft Genome Sequence of Pediococcus lolii NGRI 0510QT isolated from ryegrass silage, Genome A., 1, 00156-12.

2012年

  1. K. Doi, Y. Ohyama, E. Yokoyama, T. Nishiyama, Y. Fujino, Y. Nagayoshi, T. Ohshima and S. Ogata (2012) Expression analysis of the spi gene in the pock-forming plasmid pSA1.1 from Streptomyces azureus and localization of its product during differentiation, Appl. Microbiol. Biotechnol., 95 (3): 707-716. 
  2. T. Hirajima, Y. Aiba, M.Farahat, N. Okibe, K. Sasaki, T. Tsuruta and K. Doi (2012) Effect of microorganisms on flocculation of quartz, Int. J. Miner. Process., 102–103, 107–111.
  3. S. Bai, G. Naren, H. Noma, M. Etou, H. Ohashi, Y. Fujino, K. Doi, Y. Okaue, T. Yokoyama (2012) Silica deposition induced by isolated aluminum ions bound on chelate resin as a model compound of the surface of microbes. Colloid Surfaces B, 95, 208-213.
  4. H. Akita, K. Doi, Y. Kawarabayasi and T. Ohshima (2012) Creation of a thermostable NADP(+)-dependent D: -amino acid dehydrogenase from Ureibacillus thermosphaericus strain A1 meso-diaminopimelate dehydrogenase by site-directed mutagenesis, Biotechnol. Lett., 34:1693-1699.
  5. T. Ohmori, Y. Mutaguchi, K. Doi and T. Ohshima (2012) Effects of alkali or acid treatment on the isomerization of amino acids, J. Biosci. Bioeng., 114: 457-459.
  6. Y. Zhao, T. Wakamatsua, K. Doi, H. Sakuraba and T. Ohshima (2012) A psychrophilic leucine dehydrogenase from Sporosarcina psychrophila: Purification, characterization, gene sequencing and crystal structure analysis, J. Mol. Catal. B: Enzym., 83: 65– 72.

著書

  1. 土居克実、大島敏久（2014）「地熱発電所と微生物」、日本微生物生態学会編『環境と微生物の事典』、217-218、朝倉書店
  2. K. Doi and Y. Fujino (2013) Biomineralization in geothermal environment, In Thermophilic Microbes in Environmental and Industrial Biotechnology: Biotechnology of Thermophiles edited by T. Satyanarayana, J. Littlechild and Y. Kawarabayasi, Springer, NY, 233-247.
  3. 土居克実、門多真理子、左古知行、桜井稔三、緒方靖哉（2010）「バクテリオファージ」、日本乳酸菌学会『乳酸菌とビフィズス菌のサイエンス』、p. 431-446、京大出版会
  4. 土居克実（2009）「高度好熱性細菌を用いたバイオリーチングの基礎と応用」、吉田和哉, 池道彦, 植田充美監修『メタルバイオテクノロジーによる環境保全と資源回収』、p. 115-120、シーエムシー出版

研究助成

  1. 平成26〜27年度　NEDOエネルギー・環境新技術先導プログラム（分担）「地熱発電量を10倍化する酸性熱水利用および還元井減衰防止技術の開発」
  2. 平成26~27年度　科学技術振興機構A-STEP（研究成果最適展開支援プログラム）（代表）「耐熱性溶菌酵素を用いたファージセラピー基盤の開発
  3. 平成26~27年度　小林国際奨学財団研究助成（代表）「乳酸発酵過程におけるD-アミノ酸代謝機構の網羅的解析と効率的D-アミノ酸生産法の開発」
  4. 平成26〜29年度　科学研究費補助金　基盤研究(B)（代表）「地熱環境における好熱性微生物によるシリカバイオミネラリゼーション形成の統合解析」
  5. 平成26〜28年度　科学研究費補助金　基盤研究(B)（分担）「ネパール野生キノコのライブラリーと健康機能を含むデータベースの構築」
  6. 平成24〜25年度　科学研究費補助金　挑戦的萌芽研究（代表）「Virome miningによる極限環境からの遺伝子資源探索法の開発」
  7. 平成24年度　ソルト・サイエンス研究財団　研究助成（代表）「臨海熱水湧出域における耐塩性・超好熱ウイルスの分子系統解析と有用酵素遺伝子の探索」
  8. 平成24年度　住友財団　環境研究助成（代表）「メタルバイオテクノロジーを利用した地熱発電の多次元利用技術の創製」
  9. 平成24年度　九州大学教育研究プログラム・研究拠点形成プロジェクト（分担）「低温熱水発電に特有なシリカスケールの科学」
  10. 平成23年度　共同研究「地熱水等極限環境下に生息する有用微生物の探索」九州電力株式会社総合研究所
  11. 平成23年度　住友電工グループ社会貢献基金（代表）「バイオミネラリゼーションを利用した高純度シリカとリチウム資源回収技術の開発」
  12. 平成22年度～24年度　九州大学教育研究プログラム・研究拠点形成プロジェクト（分担）「ネパールの食品および環境中の遺伝資源の高度有効利用」
  13. 平成22年度ノボザイムズジャパン研究ファンド（代表）Characterization of novel biosilicification-related protein in Thermus thermophilus and its application to nanotechnology.

学生の受賞等

  1. 前田　純平　第52回化学関連支部合同九州大会　優秀ポスター賞「乳酸菌Lactobacillus otakiensisにおけるD-分岐鎖アミノ酸の局在と機能解析」
    前田　純平
  2. 永吉 佑子　2014年度　日本科学協会 笹川科学研究助成「好熱性繊維状ファージのゲノム・タンパク質・特性・環境相関解析による始原生命現象の探究」
    永吉 佑子
  3. 秋田 紘長 平成25年度　九州大学生物資源環境科学府賞　「Studies on creation and application of a thermostable NADP+-dependent D-amino acid dehydrogenase」（耐熱性D-アミノ酸脱水素酵素の創製と応用に関する研究）
    秋田 紘長
  4. マルトノ　ヒンドラ　第50回化学関連支部合同九州大会　優秀ポスター賞「小浜温泉より単離したファージφOH2由来耐熱性溶菌酵素の特性解析」
    マルトノ　ヒンドラ
  5. 秋田 紘長　平成25年度日本学術振興会特別研究員採用「タンパク質工学的手法による耐熱性D-アミノ酸脱水素酵素の創製と応用」
  6. マルトノ　ヒンドラ　平成24年度　九州大学農学部賞
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